根据《企业所得税法》和《企业所得税法实施条例》有关规定，2008年，科技部、财政部、税务总局制定了认定办法，联合成立了高新技术企业认定管理工作领导小组，指导各省级认定机构负责具体认定工作。认定办法实施8年来，总体运行平稳、效果良好，但随着形势发展也显露出一些问题。一是技术领域范围滞后，一些新兴产业特别是现代服务业在技术领域中体现不足。二是认定条件已不适应发展新要求，对中小企业支持力度不够。三是认定程序有待优化，后续监管也需要进一步加强。
    为了贯彻落实党的十八届五中全会提出的创新、协调、绿色、开放、共享五大发展理念，落实推进供给侧结构性改革的各项举措，用税收减法换“双创”新动能加法，以促进产业结构调整，增强持续增长动力，科技部、财政部、税务总局在广泛深入调查研究的基础上，修订完善了认定办法，经国务院批准后印发。